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 NEO第7弾で新章突入によりストーリーが一新され、CGと実写(TV版)のコラボと連動したストーリーモードとなった。
 呼称を「サーガモード」という。※今までのストーリーは遊べない
 また[[イーヴィルストライカー]]というシステムが導入されていたり、ミッション以外の隠し要素も含まれている。
-プレイヤーにつくウルトラストライカーは、各エピソードで固定されている。
+プレイヤーをサポートしてくれるウルトラストライカーは、各エピソードで固定されている。
 攻略法については、[[ストーリーモード攻略(NEO)]]を参照。
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 **NEO第7弾～
 *前編
 **エピソード１
  バキシム（火炎放射）
  エースロボット（ストロングラッシュ）
 ウルトラストライカー：ウルトラマンエース
 ミッション：ウルトラマンエースと協力してエースロボットを倒せ！
 **エピソード２
  インペライザー（ダークサテライトファイア）
  バキシマム（紅蓮火炎弾）
  イーヴィルストライカー：エースロボット
 ウルトラストライカー：ウルトラマンメビウス
 ミッション：インペライザーを倒せ！
 特殊イベント：メカザム乱入（スーパーコンボが発動し、メカザムが相手に必殺技を決めてくれる）
 **エピソード３
  ナース（ナースボディアタック）
  恐竜戦車（ダイノソアビーム）
  モチロン（モチロンボイラー）
  イーヴィルストライカー：エースロボット
 ウルトラストライカー：ウルトラマンタロウ
 ミッション：３ラウンド以内にナースを倒せ！
 特殊イベント：モチロン説得（タロウがモチロンを説得。以後、相手のチームからモチロンが外れる）
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 *中篇
 **エピソード４
  ゼットン（一兆度の火球）
  ジェロニモン（無重力光線）
  イーヴィルストライカー：にせウルトラマン
 ウルトラストライカー：ウルトラマン
 ミッション：ゼットン、ジェロニモンに攻撃を決めろ！
 特殊イベント：ウルトラマン救出（以後、ウルトラストライカーとして登場）
 **エピソード５
  ブラックキング（フルパワーヘルマグマ）
  ベムスター（スターコンビネート）
  イーヴィルストライカー：にせウルトラマン
 ウルトラストライカー：ウルトラセブン
 ミッション：ブラックキング、ベムスターに必殺技を決めろ！
 特殊イベント：ウルトラセブン救出（以後、ウルトラストライカーとして登場）
 **エピソード６
  カブト・ザ・キラー（クロー・スライサー）
  イーヴィルストライカー：にせウルトラマン
 ウルトラストライカー：ウルトラマンジャック
 ミッション：カブト・ザ・キラーにウルトラフィニッシュを決めろ！
 特殊イベント：グランデ乱入（スーパーコンボが発動し、レッドキングが相手にヴォルガニックインパクトを決めてくれる）
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 *後編
 **エピソード７
  サラマンドラ（サラマンダーテイル）
  ベロクロン（ゼンメストロアタック）
  イーヴィルストライカー：ウルトラマンシャドー
-ウルトラストライカー：ウルトラマン80
+ウルトラストライカー：ウルトラマン80(ラウンド3から)
 ミッション：サラマンドラにウルトラフィニッシュを決めろ！
 **エピソード８
  巨大ヤプール（ストレートショット）
+ウルトラストライカー：なし
 ミッション：必殺技レベル3で巨大ヤプールを倒せ！
 特殊イベント：ウルトラ兄弟の援護（必殺技パワーがＭＡＸまで溜まる）
 **エピソード９
  ウルトラマンベリアル（ベリアルデスサイズ）
 ウルトラストライカー：ウルトラマンゼロ
 ミッション：ウルトラフィニッシュでウルトラマンベリアルを倒せ！
-特殊イベント：ウルトラマンゼロ登場（以後、ウルトラストライカーとして登場）
+特殊イベント：ウルトラマンゼロ登場（ラウンド３以後、ウルトラストライカーとして登場）
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